La SONARA est dotée d’un laboratoire accrédité COFRAC (Comité Français d’Accréditation) depuis le 21 mars 2001. Le laboratoire a pour mission principale le contrôle de la qualité des produits. Il assure l'analyse de l’ensemble des produits (pétrole brut) jusqu’au produits finis. Ceci permet à la SONARA d’assurer que les produits fabriqués dans la raffinerie soient conformes aux spécifications.